A Comissão Nacional dos COMISEs é constituída pelo coordenador, vice-coordenador, dois secretários, três assessores de comunicação e o secretário nacional da Pontifícia União Missionária.

A Macrorregião Sul, por ter o maior número de dioceses e dos COMISEs no Brasil, tem dois representantes na Comissão, sendo que um deles deve ser do Regional Sul 1 (São Paulo). Sendo assim, o COMISE do Regional Sul 1 tem seu mais novo representante na Comissão Nacional dos COMISEs.

O seminarista Andrey Oliveira Silva, da Diocese de Mogi das Cruzes – SP, foi eleito como membro da Comissão Nacional dos COMISEs, nela assumirá como 3º assessor de comunicação, com a missão de fomentar nos futuros presbíteros a consciência da missão como identidade do cristão, favorecendo-lhes uma sólida espiritualidade e formação missionária que os tornem capazes de enfrentar os desafios da ação evangelizadora da Igreja no Brasil.